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Expanded national database collection and data coverage in the FINDbase worldwide database for clinically relevant genomic variation allele frequencies

机译:在FINDbase全球数据库中扩大了国家数据库的收集和数据覆盖范围以提供具有临床意义的基因组变异等位基因频率

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摘要

FINDbase () is a comprehensive data repository that records the prevalence of clinically relevant genomic variants in various populations worldwide, such as pathogenic variants leading mostly to monogenic disorders and pharmacogenomics biomarkers. The database also records the incidence of rare genetic diseases in various populations, all in well-distinct data modules. Here, we report extensive data content updates in all data modules, with direct implications to clinical pharmacogenomics. Also, we report significant new developments in FINDbase, namely (i) the release of a new version of the ETHNOS software that catalyzes development curation of national/ethnic genetic databases, (ii) the migration of all FINDbase data content into 90 distinct national/ethnic mutation databases, all built around Microsoft's PivotViewer () software (iii) new data visualization tools and (iv) the interrelation of FINDbase with DruGeVar database with direct implications in clinical pharmacogenomics. The abovementioned updates further enhance the impact of FINDbase, as a key resource for Genomic Medicine applications.
机译:FINDbase()是一个全面的数据库,可记录全球各种人群中临床相关基因组变异的流行情况,例如主要导致单基因疾病和药物基因组生物标志物的致病变异。该数据库还以完全不同的数据模块记录了各种人群中罕见遗传病的发生率。在这里,我们报告了所有数据模块中大量数据内容的更新,直接影响了临床药物基因组学。此外,我们报告了FINDbase的重大新进展,即(i)发行了新版本的ETHNOS软件,以促进国家/种族遗传数据库的开发管理;(ii)将所有FINDbase数据内容迁移到90个不同的国家/地区种族突变数据库,均基于Microsoft的PivotViewer()软件(iii)新的数据可视化工具,以及(iv)FINDbase与DruGeVar数据库的相互联系,直接影响了临床药物基因组学。上述更新进一步增强了FINDbase的影响,它是基因组医学应用程序的重要资源。

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