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The BIG Data Center: from deposition to integration to translation

机译:BIG数据中心:从沉积到集成再到翻译

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摘要

Biological data are generated at unprecedentedly exponential rates, posing considerable challenges in big data deposition, integration and translation. The BIG Data Center, established at Beijing Institute of Genomics (BIG), Chinese Academy of Sciences, provides a suite of database resources, including (i) Genome Sequence Archive, a data repository specialized for archiving raw sequence reads, (ii) Gene Expression Nebulas, a data portal of gene expression profiles based entirely on RNA-Seq data, (iii) Genome Variation Map, a comprehensive collection of genome variations for featured species, (iv) Genome Warehouse, a centralized resource housing genome-scale data with particular focus on economically important animals and plants, (v) Methylation Bank, an integrated database of whole-genome single-base resolution methylomes and (vi) Science Wikis, a central access point for biological wikis developed for community annotations. The BIG Data Center is dedicated to constructing and maintaining biological databases through big data integration and value-added curation, conducting basic research to translate big data into big knowledge and providing freely open access to a variety of data resources in support of worldwide research activities in both academia and industry. All of these resources are publicly available and can be found at .
机译:生物数据以前所未有的指数速度生成,这对大数据的存储,集成和翻译提出了巨大的挑战。在中国科学院北京基因组研究所(BIG)建立的BIG数据中心提供了一套数据库资源,包括(i)Genome Sequence Archive,这是专门用于存档原始序列读数的数据库,(ii)基因表达Nebulas,一个完全基于RNA-Seq数据的基因表达谱数据门户,(iii)基因组变异图,特征物种的基因组变异的全面集合,(iv)Genome Warehouse,一个包含特定基因组规模数据的集中资源(v)甲基化银行,一个全基因组单碱基解析甲基化基因组的综合数据库,以及(vi)科学维基,这是为社区注释而开发的生物维基的中央访问点,专注于重要的动植物。 BIG数据中心致力于通过大数据集成和增值管理来构建和维护生物数据库,进行基础研究以将大数据转化为大知识,并提供对各种数据资源的自由开放访问以支持全球范围内的研究活动。无论是学术界还是工业界。所有这些资源都是公开可用的,可以在找到。

著录项

  • 期刊名称 Nucleic Acids Research
  • 作者

  • 作者单位
  • 年(卷),期 2017(45),Database issue
  • 年度 2017
  • 页码 D18–D24
  • 总页数 7
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种
  • 中图分类 分子生物学;
  • 关键词

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