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Effect of binding on escape from cavity through narrow tunnel

机译:约束对通过狭窄隧道从空腔逸出的影响

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摘要

When a diffusing particle escapes from a spherical cavity through a narrow, not too long tunnel, the escape kinetics is essentially single-exponential. The presence of reversible binding sites on the cavity wall leads to retention of the particle in the system and converts the single-exponential kinetics into bi-exponential. We develop a theory that describes these effects. The theory shows how the delay time and the average number of binding events depend on the geometric and kinetic parameters of the system. To study the effect of the cavity shape, we also analyze the kinetics when the particle escapes from a cylindrical cavity with reversible binding sites.
机译:当扩散粒子通过狭窄但不太长的通道从球形腔逸出时,逸出动力学本质上是单指数的。腔壁上可逆结合位点的存在导致颗粒保留在系统中,并将单指数动力学转化为双指数动力学。我们开发了描述这些影响的理论。该理论说明了延迟时间和平均结合事件数如何取决于系统的几何和动力学参数。为了研究腔体形状的影响,我们还分析了当颗粒从具有可逆结合位点的圆柱形腔体中逸出时的动力学。

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