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Flower: extracting information from pyrosequencing data

机译:花:从焦磷酸测序数据中提取信息

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摘要

>Summary: The SFF file format produced by Roche's 454 sequencing technology is a compact, binary format that contains the flow values that are used for base and quality calling of the reads. Applications, e.g. in metagenomics, often depend on accurate sequence information, and access to flow values is important to estimate the probability of errors. Unfortunately, the programs supplied by Roche for accessing this information are not publicly available. Flower is a program that can extract the information contained in SFF files, and convert it to various textual output formats.>Availability: Flower is freely available under the General Public License.>Contact:
机译:>摘要::罗氏454测序技术产生的SFF文件格式是一种紧凑的二进制格式,其中包含用于读取的碱基和质量调用的流值。应用程序,例如在宏基因组学中,通常取决于准确的序列信息,访问流量值对于估计错误的可能性很重要。不幸的是,罗氏公司提供的用于访问此信息的程序尚未公开。 Flower是一个程序,可以提取SFF文件中包含的信息,并将其转换为各种文本输出格式。>可用性: Flower是根据通用公共许可免费提供的。>联系方式:

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