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RuleBender: a visual interface for rule-based modeling

机译:RuleBender:用于基于规则的建模的可视界面

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摘要

>Summary: Rule-based modeling (RBM) is a powerful and increasingly popular approach to modeling intracellular biochemistry. Current interfaces for RBM are predominantly text-based and command-line driven. Better visual tools are needed to make RBM accessible to a broad range of users, to make specification of models less error prone and to improve workflows. We present RULEBENDER, an open-source visual interface that facilitates interactive debugging, simulation and analysis of RBMs.>Availability: RULEBENDER is freely available for Mac, Windows and Linux at .>Contact: ; >Supplementary information: are available at Bioinformatics online.
机译:>概述:基于规则的建模(RBM)是一种功能强大且日益流行的细胞内生物化学建模方法。当前用于RBM的界面主要基于文本和命令行驱动。需要更好的可视化工具,以使RBM可以被广泛的用户使用,使模型的规范不易出错,并改善工作流程。我们提供了RULEBENDER,这是一个开放源代码的可视界面,可促进对RBM的交互式调试,仿真和分析。>可用性: RULEBENDER可在Mac,Windows和Linux上免费获得。>联系方式:; >补充信息:可在线访问生物信息学。

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