首页> 美国卫生研究院文献>Bioinformatics >SDRS—an algorithm for analyzing large-scale dose–response data
【2h】

SDRS—an algorithm for analyzing large-scale dose–response data

机译:SDRS —一种分析大规模剂量反应数据的算法

代理获取
本网站仅为用户提供外文OA文献查询和代理获取服务,本网站没有原文。下单后我们将采用程序或人工为您竭诚获取高质量的原文,但由于OA文献来源多样且变更频繁,仍可能出现获取不到、文献不完整或与标题不符等情况,如果获取不到我们将提供退款服务。请知悉。

摘要

>Summary: Dose–response information is critical to understanding drug effects, yet analytical methods for dose–response assays cannot cope with the dimensionality of large-scale screening data such as the microarray profiling data. To overcome this limitation, we developed and implemented the Sigmoidal Dose Response Search (SDRS) algorithm, a grid search-based method designed to handle large-scale dose–response data. This method not only calculates the pharmacological parameters for every assay, but also provides built-in statistic that enables downstream systematic analyses, such as characterizing dose response at the transcriptome level.>Availability: Bio::SDRS is freely available from CPAN ().>Contacts: ; >Supplementary Information: is available at Bioinformatics online.
机译:>摘要:剂量-反应信息对于理解药物作用至关重要,但是剂量-反应分析的分析方法无法应对大规模筛选数据(例如微阵列分析数据)的维度。为了克服这一限制,我们开发并实施了Sigmoidal剂量响应搜索(SDRS)算法,该算法是一种基于网格搜索的方法,旨在处理大规模剂量响应数据。该方法不仅可以计算每种测定的药理学参数,而且还提供了内置的统计数据,可以进行下游系统分析,例如在转录组水平上表征剂量反应。>可用性: Bio :: SDRS是免费的可从CPAN()获得。>联系人:; >补充信息:可在线访问生物信息学。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
代理获取

客服邮箱:kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备:11010802029741号 ICP备案号:京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有
  • 客服微信

  • 服务号