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Isoform-level gene expression patterns in single-cell RNA-sequencing data

机译:单细胞RNA测序数据中亚型水平的基因表达模式

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摘要

MotivationRNA sequencing of single cells enables characterization of transcriptional heterogeneity in seemingly homogeneous cell populations. Single-cell sequencing has been applied in a wide range of researches fields. However, few studies have focus on characterization of isoform-level expression patterns at the single-cell level. In this study, we propose and apply a novel method, ISOform-Patterns (ISOP), based on mixture modeling, to characterize the expression patterns of isoform pairs from the same gene in single-cell isoform-level expression data.
机译:单个细胞的动机RNA测序可以表征看似均质的细胞群体中的转录异质性。单细胞测序已被广泛应用于研究领域。但是,很少有研究集中在单细胞水平的同工型水平表达模式的表征。在这项研究中,我们提出并应用一种新的方法,即基于混合物模型的ISOform-Patterns(ISOP),以表征单细胞同工型水平表达数据中同一基因的同工型对的表达模式。

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