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PReFerSim: fast simulation of demography and selection under the Poisson Random Field model

机译:PReFerSim:泊松随机场模型下人口统计和选择的快速仿真

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摘要

>Summary: The Poisson Random Field (PRF) model has become an important tool in population genetics to study weakly deleterious genetic variation under complicated demographic scenarios. Currently, there are no freely available software applications that allow simulation of genetic variation data under this model. Here we present PReFerSim, an ANSI C program that performs forward simulations under the PRF model. PReFerSim models changes in population size, arbitrary amounts of inbreeding, dominance and distributions of selective effects. Users can track summaries of genetic variation over time and output trajectories of selected alleles.>Availability and Implementation: PReFerSim is freely available at: >Contact: >Supplementary information: are available at Bioinformatics online.
机译:>摘要:泊松随机场(Poisson Random Field,PRF)模型已成为人口遗传学中研究复杂人口场景下微弱遗传变异的重要工具。当前,没有免费可用的软件应用程序可以在此模型下模拟遗传变异数据。在这里,我们介绍PReFerSim,这是一个ANSI C程序,可以在PRF模型下执行正向仿真。 PReFerSim对种群大小,近交的任意数量,优势和选择性效应的分布进行建模。用户可以跟踪随时间变化的遗传变异摘要以及所选等位基因的输出轨迹。>可用性和实现: PReFerSim可从以下地址免费获得:>联系方式: >补充信息:可在生物信息学在线获得。

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