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Molecular Dynamics Simulation of Surfactin Molecules at the Water-Hexane Interface

机译:水-己烷界面上的表面肌动蛋白分子的分子动力学模拟

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摘要

The dynamics of surfactin, a lipopeptide surfactant from Bacillus subtilis, has been studied by molecular dynamics at different interfacial concentrations in a water-hexane medium reproducing a hydrophilic/hydrophobic biphasic system. The shapes and orientations of surfactin molecules, as hydrogen bonds and Ramachandran angles, have been recorded to investigate the environment effect on the molecular structure. We demonstrate that the peptidic backbone can exhibit a large flexibility and that conformational motions and structural fluctuations depend strongly on the interfacial concentration. Moreover, we have measured the surface activity of this biosurfactant by computing the interfacial tension and lateral and rotational diffusion coefficients.
机译:表面活性剂(一种枯草芽孢杆菌的脂肽表面活性剂)的动力学已在重现亲水/疏水双相系统的水-己烷介质中通过不同界面浓度下的分子动力学进行了研究。表面活性素分子的形状和取向,如氢键和拉马坎德兰角,已被记录下来,以研究环境对分子结构的影响。我们证明肽主链可以表现出很大的灵活性,并且构象运动和结构波动强烈取决于界面浓度。此外,我们已经通过计算界面张力以及横向和旋转扩散系数来测量了这种生物表面活性剂的表面活性。

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