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MCtandem: an efficient tool for large-scale peptide identification on many integrated core (MIC) architecture

机译:MCtandem:在许多集成核心(MIC)架构上进行大规模多肽鉴定的有效工具

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摘要

BackgroundTandem mass spectrometry (MS/MS)-based database searching is a widely acknowledged and widely used method for peptide identification in shotgun proteomics. However, due to the rapid growth of spectra data produced by advanced mass spectrometry and the greatly increased number of modified and digested peptides identified in recent years, the current methods for peptide database searching cannot rapidly and thoroughly process large MS/MS spectra datasets. A breakthrough in efficient database search algorithms is crucial for peptide identification in computational proteomics.
机译:背景基于串联质谱(MS / MS)的数据库搜索是shot弹枪蛋白质组学中肽段识别的一种广为认可和广泛使用的方法。但是,由于近年来通过先进的质谱技术产生的光谱数据迅速增长,并且鉴定出的修饰和消化的肽数量大大增加,当前用于肽数据库搜索的方法无法快速,彻底地处理大型MS / MS光谱数据集。有效的数据库搜索算法的突破对于计算蛋白质组学中的多肽鉴定至关重要。

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