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Priority-Lasso: a simple hierarchical approach to the prediction of clinical outcome using multi-omics data

机译:Priority-Lasso:使用多组学数据预测临床结果的简单分层方法

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摘要

BackgroundThe inclusion of high-dimensional omics data in prediction models has become a well-studied topic in the last decades. Although most of these methods do not account for possibly different types of variables in the set of covariates available in the same dataset, there are many such scenarios where the variables can be structured in blocks of different types, e.g., clinical, transcriptomic, and methylation data. To date, there exist a few computationally intensive approaches that make use of block structures of this kind.
机译:背景技术在过去的几十年中,将高维组学数据包含在预测模型中已成为一个经过充分研究的话题。尽管这些方法大多数都不能解释同一数据集中可用的一组协变量中可能存在的不同类型的变量,但是在许多情况下,变量可以按不同类型的块进行结构化,例如临床,转录组和甲基化数据。迄今为止,存在一些使用这种块结构的计算密集型方法。

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