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BIOCAT: a pattern recognition platform for customizable biological image classification and annotation

机译:BIOCAT:一种模式识别平台用于可定制的生物图像分类和注释

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摘要

BackgroundPattern recognition algorithms are useful in bioimage informatics applications such as quantifying cellular and subcellular objects, annotating gene expressions, and classifying phenotypes. To provide effective and efficient image classification and annotation for the ever-increasing microscopic images, it is desirable to have tools that can combine and compare various algorithms, and build customizable solution for different biological problems. However, current tools often offer a limited solution in generating user-friendly and extensible tools for annotating higher dimensional images that correspond to multiple complicated categories.
机译:背景模式识别算法在生物图像信息学应用中非常有用,例如量化细胞和亚细胞对象,注释基因表达和分类表型。为了对不断增加的显微图像提供有效和高效的图像分类和注释,希望具有可以组合和比较各种算法并针对不同生物学问题构建可定制解决方案的工具。但是,当前的工具在生成用于注释与多个复杂类别相对应的高维图像的用户友好和可扩展的工具时通常提供了有限的解决方案。

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