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Incremental genetic K-means algorithm and its application in gene expression data analysis

机译:增量遗传K-means算法及其在基因表达数据分析中的应用

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摘要

BackgroundIn recent years, clustering algorithms have been effectively applied in molecular biology for gene expression data analysis. With the help of clustering algorithms such as K-means, hierarchical clustering, SOM, etc, genes are partitioned into groups based on the similarity between their expression profiles. In this way, functionally related genes are identified. As the amount of laboratory data in molecular biology grows exponentially each year due to advanced technologies such as Microarray, new efficient and effective methods for clustering must be developed to process this growing amount of biological data.
机译:背景技术近年来,聚类算法已有效地应用于分子生物学中的基因表达数据分析。借助K-means,层次聚类,SOM等聚类算法,根据基因表达谱之间的相似性将基因分为几组。以这种方式,鉴定了功能相关的基因。由于诸如微阵列之类的先进技术,分子生物学中的实验室数据量每年呈指数级增长,因此必须开发新的高效聚类方法来处理这一数量不断增长的生物数据。

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