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Genome sequence of the organohalide-respiring Dehalogenimonas alkenigignens type strain (IP3-3T)

机译:呼吸有机卤化物的Dehalogenimonas alkenigignens型菌株(IP3-3T)的基因组序列

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摘要

Dehalogenimonas alkenigignens IP3-3T is a strictly anaerobic, mesophilic, Gram negative staining bacterium that grows by organohalide respiration, coupling the oxidation of H2 to the reductive dehalogenation of polychlorinated alkanes. Growth has not been observed with any non-polyhalogenated alkane electron acceptors. Here we describe the features of strain IP3-3T together with genome sequence information and its annotation. The 1,849,792 bp high-quality-draft genome contains 1936 predicted protein coding genes, 47 tRNA genes, a single large subunit rRNA (23S-5S) locus, and a single, orphan, small unit rRNA (16S) locus. The genome contains 29 predicted reductive dehalogenase genes, a large majority of which lack cognate genes encoding membrane anchoring proteins.
机译:Dehalogenimonas alkenigignens IP3-3 T 是一种严格的厌氧,嗜温革兰氏阴性细菌,通过有机卤化物呼吸而生长,将H2的氧化与多氯代烷烃的还原性脱卤反应耦合。没有观察到任何非多卤代烷烃电子受体的生长。在这里,我们描述了IP3-3 T 菌株的特征以及基因组序列信息及其注释。 1,849,792 bp的高质量草图基因组包含1936个预测的蛋白质编码基因,47个tRNA基因,一个大的亚单位rRNA(23S-5S)基因座和一个孤立的小单位rRNA(16S)基因座。基因组包含29个预测的还原性脱卤素酶基因,其中大多数缺乏编码膜锚定蛋白的同源基因。

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