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The Genome Sequence DataBase version 1.0 (GSDB): from low pass sequences to complete genomes.

机译:基因组序列数据库版本1.0(GSDB):从低通序列到完整的基因组。

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摘要

The Genome Sequence DataBase (GSDB) has completed its conversion to an improved relational database. The new database, GSDB 1.0, is fully operational and publicly available. Data contributions, including both original sequence submissions and community annotation, are being accomplished through the use of a graphical client-server interface tool, the GSDB Annotator, and via GIO (GSDB Input/Output) files. Data retrieval services are being provided through a new Web Query Tool and direct SQL. All methods of data contribution and data retrieval fully support the new data types that have been incorporated into GSDB, including discontiguous sequences, multiple sequence alignments, and community annotation.
机译:基因组序列数据库(GSDB)已完成其向改进的关系数据库的转换。新的数据库GSDB 1.0已完全投入使用并公开可用。数据贡献,包括原始序列提交和社区注释,都可以通过使用图形客户端-服务器界面工具GSDB Annotator和GIO(GSDB输入/输出)文件来完成。通过新的Web查询工具和直接SQL提供数据检索服务。数据贡献和数据检索的所有方法完全支持GSDB中已合并的新数据类型,包括不连续序列,多个序列比对和社区注释。

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