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Heterogeneous PreferentialSolvation of Water andTrifluoroethanol in Homologous Lysozymes

机译:异构优惠水和溶剂化同源溶菌酶中的三氟乙醇

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摘要

Cytoplasmic osmolytes can significantly alter the thermodynamic and kinetic properties of proteins relative to those under dilute solution conditions. Spectroscopic experiments of lysozymes in cosolvents indicate that such changes may arise from the heterogeneous, site-specific hydrophobic interactions between protein surface residues and individual solvent molecules. In pursuit of an accurate and predictive model for explaining biomolecular interactions, we study the averaged structural characteristics of mixed solvents with homologous lysozyme solutes using all-atom molecular dynamics. By observing the time-averaged densities of different aqueous solutions of trifluoroethanol, we deduce trends in the heterogeneous solvent interactions over each protein’s surface, and investigate how the homology of protein structure does not necessarily translate to similarities in solvent structure and composition—even when observing identical side chains.
机译:相对于稀溶液条件下的蛋白质,细胞质渗透物可以显着改变蛋白质的热力学和动力学特性。助溶剂中溶菌酶的光谱实验表明,这种变化可能源于蛋白质表面残基与单个溶剂分子之间异质的,位点特异性的疏水相互作用。为了寻求用于解释生物分子相互作用的准确和可预测的模型,我们使用全原子分子动力学研究了具有同源溶菌酶溶质的混合溶剂的平均结构特征。通过观察三氟乙醇的不同水溶液的时间平均密度,我们推断出每种蛋白质表面上异质溶剂相互作用的趋势,并研究蛋白质结构的同源性如何不一定转化为溶剂结构和组成的相似性,即使是观察时相同的侧链。

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