基于网络药理学预测芹菜素治疗系统性红斑狼疮的机制

摘要

目的通过网络药理学预测芹菜素治疗系统性红斑狼疮(SLE)的潜在靶点以及涉及的信号通路。方法通过SwissTargetPrediction及PharmMapper数据库预测芹菜素的潜在靶点,用OMIM、GeneCards、DrugBank和PharmGKB等数据库收集SLE疾病相关靶点。从STRING数据库获取蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI),并运用Cytoscape 3.8.2软件绘制芹菜素-SLE的PPI图,并筛选核心靶点。基于DAVID数据库和Bioconductor生物信息软件包对共同靶点进行基因功能(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过双荧光素酶报告基因实验验证芹菜素对所筛选通路的调控作用。结果共筛选出芹菜素潜在靶点77个,SLE相关靶点1016个,芹菜素-SLE共同靶点21个,其中核心靶点3个:ALB、HSP90AA1、ESR1;GO分析结果包括37条生物学功能、12条细胞组成过程和26条分子功能过程;KEGG通路分析显示与12条通路相关,主要涉及雌激素信号通路、NF-κB信号通路、精氨酸和脯氨酸代谢通路等经典通路。双荧光素酶报告基因实验结果显示芹菜素可抑制ERα、ERβ和NF-κB的转录。结论网络药理学的研究结果提示,芹菜素治疗SLE有多靶点、多途径的特点,可以通过调控雌激素信号通路和NF-κB信号通路,从而抑制下游基因及炎症因子的表达,改善SLE。