基于网络药理学和分子对接探讨桃红四物汤治疗类风湿关节炎的作用机制

摘要

目的:运用网络药理学和分子对接技术探讨桃红四物汤治疗类风湿关节炎的作用机制,为临床应用提供理论依据.方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索桃红四物汤的有效成分及作用靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、PharmGkb、DrugBank数据库收集疾病相关靶点.运用Cytoscape 3.6.1软件构建"化合物-靶点"网络,借助STRING平台构建交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并使用Cytoscape对网络进行拓扑分析,获取核心基因,通过R语言进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后将核心基因与主要活性成分进行分子对接验证.结果:TCMSP检索得到桃红四物汤治疗RA的有效成分41个,对应靶点154个;拓扑分析得到AKT1、JUN、TP53、MMP9、MAPK14等10个核心基因.GO富集分析共涉及生物过程(BP)2316个,细胞组分(CC)75个,分子功能(MF)205个,KEGG通路富集分析筛选得到158条与RA相关通路,主要涉及P13K-AKT、白细胞介素17、肿瘤坏死因子等信号通路,集中调控炎症、血管翳形成、细胞增殖与凋亡等.分子对接结果表明,主要活性化合物能够分别与核心靶点结合,并展现出较好的亲和力.结论:本研究对桃红四物汤治疗RA的多成分、多靶点、多通路的作用与机制进行初步探讨,可为后续基础研究提供参考,为临床应用提供理论依据.