肾综合征出血热疫苗候选毒株A16株的分子特性

摘要

为研究肾综合征出血热疫苗候选毒株A16株的分子基础 ,应用RT -PCR方法扩增并测定了A16株的M和S片段的序列 ,结果A16株M片段的全基因序列共 36 15个核苷酸 ,编码 1133个氨基酸。S片段的全基因序列共1770个核苷酸 ,编码 4 2 9个氨基酸。A16株M片段核苷酸全基因序列及其推导的氨基酸与HTN型毒株同源率为75 .5 %～ 90 .3%和 85 .9%～ 97.1% ,即A16与HTN同型毒株间的差异高达 9.7%～ 2 4 .3%和 2 .9%～ 14 .1% ,而与SEO型的同源率比较 ,核苷酸和氨基酸分别仅为 70 .2 %～ 70 .8%和 73.4 %～ 76 .7%。S片段的序列同源率与M片段的结果相类似 ,即核苷酸和氨基酸的同源率与HTN型毒株分别为 76 .0 %～ 90 %和 92 .1%～ 97.7% ,与SEO型为6 7.0 %～ 6 7.7%和 81.7%～ 82 .6 %。结果显示 ,A16株虽然属于HTN型 。