基于网络药理学探究温阳通淋汤对于肾盂肾炎的炎症抵抗机制

摘要

本研究采用网络药理学和分子对接技术研究温阳通淋汤抵抗肾盂肾炎(pyelonephritis)炎症发生的主要化学成分、作用靶点以及相关信号通路,探讨其通过多成分多靶点多通路的潜在作用机制。通过TCMSP数据库检索温阳通淋汤的化学成分;运用PubChem数据库和Swiss Target Prediction数据库筛选其潜在靶点;借助GeneCards数据库、OMIM数据库、DisGeNET数据库检索肾盂肾炎相关靶点,与温阳通淋汤化合物靶点进行交集筛选出共同靶点作为潜在研究靶点;使用Cytoscape 3.5.0软件构建“中药-化学成分-靶点-疾病”网络;将上述共同靶点导入STRING数据库获取数据后在Cytoscape 3.5.0软件中构建蛋白质蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction,PPI),然后进行核心靶点筛选;利用DAVID数据库进行GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析;使用TCMSP数据库、Uniprot数据库、SYBYL-X 2.0软件进行分子对接。结果显示温阳通淋汤的“中药-化学成分-靶点-疾病”网络包含58个化学成分和92个治疗肾盂肾炎炎症反应的潜在靶点;另PPI网络中核心靶点主要涉及TNF、ALB、GAPDH、IL6、EGFR和VEGFA等;GO功能富集得到GO-BP条目263条,GO-CC条目38条,GO-MF条目58条;KEGG通路富集筛选得到94条信号通路,主要集中在PI3K-AKT信号通路和HIF-1信号通路等。分子对接结果显示,温阳通淋汤的核心化合物中的芍药苷、芍药内酯苷、鞣花酸和黄芩素等成分对ALB、EGFR及GAPDH等具有较高的亲和力。温阳通淋汤可通过多成分、多靶点和多通路调控炎症因子释放,从而达到抵抗肾盂肾炎炎症反应的效果,为其后续的实验研究奠定一定的基础。