基于网络药理学和分子对接探讨中药赤芍抗胃癌的作用机制

摘要

本文旨在运用网络药理学方法以及分子对接技术对中药赤芍抗胃癌的作用机制进行探讨。通过TCMSP数据库平台及文献检索筛选赤芍有效成分和药物所对应靶点,通过PharmMapper数据库对靶点进行补充并采用Uniport数据库将靶点名称转化成基因名,使用Cytoscape 3.7.2软件构建赤芍成分-作用靶点网络,利用OMIM和GeneCard数据库查询胃癌疾病相关靶点。将成分靶点和疾病靶点的交集靶点导入String数据库构建PPI网络,通过David数据库对交集靶点进行KEGG通路和GO富集分析并构建赤芍关键成分-作用靶点-通络网络。使用AutoDock Tools 1.5.6对关键成分和关键靶点进行分子对接,通过PyMOL进行可视化处理。结果显示,共筛选出31个赤芍活性成分,其中关键成分包括baicalein、beta-sitosterol、Stigmasterol和salicylic acid等15个通过PPI网络筛选出17个潜在治疗胃癌的关键疾病靶点,包括ALB、AKT1、IL6和TP53等;赤芍可参与凋亡过程的负调控、药物反应及核糖核酸聚合酶Ⅱ启动子转录正调控等生物过程,调控癌症、TNF及HIF-1等信号通路来发挥抗胃癌的作用;分子对接结果显示中药赤芍关键成分与AKT1、ALB、IL6、TP53和VEGFA靶蛋白具有较好的结合作用。通过运用网络药理学方法初步揭示了中药赤芍通过多成分、多靶点及多通路相互作用来发挥抗胃癌疾病的作用机制,为赤芍抗肿瘤药效物质基础提供参考。