基于网络药理学和分子对接探讨紫草治疗胃癌的作用机制

摘要

本研究利用中药网络药理学及分子对接方法探讨紫草治疗胃癌的作用机制.首先通过TCMSP数据库对紫草的有效成分进行筛选及在SwissTargetPrediction数据库进行靶点预测,并利用Cytoscape软件构建"成分—靶点"网络;其次在GeneCards数据库收集胃癌靶点并与紫草靶点取交集,得出紫草治疗胃癌的有效靶点,并通过STRING数据库构建PPI网络、Metascape数据库进行基因GO分析和KEGG通路分析、AutoDockVina软件进行分子对接.结果 显示,通过筛选得出紫草的有效成分有11个、靶点有110个,收集到胃癌靶点3000个,交集得出紫草治疗胃癌的靶点有65个.基因GO分析得出激素刺激的反应、脂质生物合成过程等生物过程9个;脂质结合、磷酸转移酶活性等功能分子10个;膜筏、受体复合物等细胞组成10个.KEGG通路分析得出癌症的途径、PPAR信号通路、肿瘤中的microRNA等共15条通路与之密切相关.分子对接结果表明其中活性成分紫草素与关键靶点AKT1的对接亲和度最高,为-36.78 kJ/mol.本研究初步证明了紫草主要通过多靶点、多通路和多途径对胃癌发挥治疗作用,可为进一步实验研究和临床应用提供依据.