山羊EGR4、KDM4C和KDM6A多态性及其与繁殖性能关联分析

摘要

本研究旨在分析EGR4、KDM4C和KDM6A单核苷酸多态性(SNPs)与山羊繁殖性状的关联。利用MassARRAY?SNP分型技术对EGR4、KDM4C和KDM6A的SNPs位点进行分型,检测其在云上黑山羊(n=544)、济宁青山羊(n=133)和辽宁绒山羊(n=91)3个群体中的遗传学特征,并将其多态性与繁殖性状表型(产羔数、初生窝重、断奶窝重)进行关联分析。群体遗传学结果表明,EGR4 g.11029053G>T和g.11029600T>A位点在云上黑山羊中为中度多态(0.25 A位点在3种山羊群体中为低度多态(PICA位点在济宁青山羊中为中度多态(0.25 A和g.37768026C>G位点在3种山羊群体中为低度多态(PICA在济宁青山羊和辽宁绒山羊中为中度多态(0.25 A、g.11029053G>T和g.11029600T>A位点在3种山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);KDM4C g.37764228T>A、g.37767773T>A和g.37768026C>G在3种山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);KDM6A g.27102554T>A和g.27177505C>A位点分别在辽宁绒山羊中和济宁青山羊中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P0.05)。关联分析结果表明,在云上黑山羊中EGR4 g.11029600T>A位点TT型的初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(PA位点TT和TA型的产羔数、初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(PA位点CC型产羔数显著高于CA型和AA型(PA位点TT型的初生窝重和断奶窝重显著高于AA型(PA、KDM4C g.37764228T>A和KDM6A g.27102554T>A位点可作为云上黑山羊窝重选择的潜在分子标记;KDM4Cg.37764228T>A和KDM6Ag.27177505C>A位点可作为云上黑山羊产羔数选择的潜在分子标记。