谷子GRF基因家族鉴定与分析

摘要

[目的]系统分析谷子GRF基因家族在谷子中如何发挥作用.[方法]基于谷子基因组数据库和生物信息学方法,鉴定谷子GRF基因家族的基因结构、基本特征、编码蛋白结构和潜在的磷酸化位点,并以序列比对进行系统进化分析.[结果]谷子含有10个GRF基因,含有2-4个外显子,分布于谷子第1、2、4、7、8和9号染色体上.MEME保守基序分析显示,谷子GRF蛋白均含有保守的QLQ (PF08880)和WRC(PF08879)结构域.磷酸化位点分析表明谷子GRF蛋白均含有大量的潜在磷酸化位点.[结论]为今后揭示谷子GRF蛋白的功能及其翻译后修饰提供重要参考.