基于SSR标记不同距离聚类与抽样方法构建辣椒核心种质库

摘要

为最大限度地保存辣椒原群体的遗传变异度,利用SSR分子标记技术比较不同距离聚类和抽样方法构建辣椒的核心种质库.结果表明:在马氏距离下,4种抽样比例中当抽样比例达20％和25％时均值差异百分率MD％为0;在相同欧氏距离下,4种抽样比例中,以10％、15％和20％比例进行抽样均值差异百分率(MD％)为0.在采用的8种聚类方法中,只有最短距离法均值差异百分率(MD％)为最小值0.不同取样法,变异系数变化率为多次聚类偏离度取样法(107.06％)＞多次聚类随机取样法(101.18％)＞多次聚类优先取样法(59.57％).从97份参试材料中筛选出沿河2、德江5、石阡3、台江1、仁怀4、务川2、遵义5、河南1和海南1共计9份核心种质,均匀分布于不同的类群中.结论:在欧氏距离下,按10％比例进行抽样,用多次聚类随机取样法取样、最短遗传距离法进行聚类分析为构建辣椒核心种质库的最佳选择.