桂花SVP同源基因的克隆及序列分析

摘要

试验以桂花'日香桂'Osmanthus fragrans cv.rixianggui嫩叶为试验材料,根据转录组数据库中SVP基因的保守序列信息,通过PCR方法克隆得到日香桂SVP基因,将其命名为OfSVP,运用在线生物信息学分析工具对OfSVP序列进行分析.结果表明:OfSVP基因全长1325 bp,开放阅读框(ORF)为687 bp,编码228个氨基酸.氨基酸序列保守性分析发现,OfSVP所编码的蛋白中含有MADS-box基因家族特有的K-box区域.通过ProtParam ExPASy在线软件分析OfSVP蛋白质分子式为C1121H1859N327O364S9,分子量为26030.60 Da,理论等电点PI值为5.80.不稳定指数为68.10,属于不稳定蛋白质.蛋白氨基酸序列比对和系统发育进化分析结果表明OfSVP与油橄榄(Olea europaea)、黄连(Coptis chinensis)和芝麻(Sesamum indicum)的同源性分别达到94％、83％和82％;OfSVP基因的克隆与序列分析对于进一步了解桂花'日香桂'成花机理具有重要意义.