珠母贝属6个种的ITS 2分子标记研究

摘要

对珠母贝属的大珠母贝、珠母贝、白珠母贝、黑珠母贝、长耳珠母贝、黑珠母贝和合浦珠母贝6个种的内部转录间隔区2(ITS2)序列及其两侧的5.8S和28S的部分序列进行了比较分析.其中黑珠母贝的序列来自GenBank.PCR扩增片段大小为600 bp左右,测序结果表明,ITS 2长211～254 bp,两端的5.8S和28S分别长84 bp和272 bp(均含引物).序列比对分析结果表明,5.8S和28S序列高度保守,不适合于种类鉴定,而ITS 2序列高度变异,270个比对位点中有146个位点发生突变,其中72个位点发生插入/缺失突变.除白珠母贝和黑珠母贝之间的遗传距离较小外,其余种类之间的遗传距离远远大于种内遗传距离.基因型分析表明,每个种具有各自特有的基因型.基因型和序列变异分析表明ITS 2序列可作为珍珠贝种类鉴定的分子标记.可用于种间、杂交育种、幼体和珍珠贝肉等材料的种类鉴定与遗传分析.