黑眉锦蛇的肝脏转录组分析

摘要

黑眉锦蛇Elaphe taeniura广泛分布于东亚和东南亚,具有重要的生态学价值和经济学价值.蛇的肝脏是一个重要的代谢器官,具有重要研究价值,然而至今没有转录组数据信息.本研究应用Illumina Hiseq 2000测序仪对黑眉锦蛇肝脏cDNA进行转录组测序,分析其基因表达谱并进行功能分类.得到总reads 14 807 224对,平均读长长度为93 bp.进行de novo组装后,得到93 357个contigs,71 119个unigenes,共有88 907个contigs找到蛋白编码序列,共有26 134个预测蛋白可以在24种类别中注释其生物学功能.同时筛选到253个参与防御机制的蛋白.这些基因的发现为充实爬行动物基因组数据库提供了基础数据,同时也为蛇类资源保护、养殖以及药物开发利用提供参考.