一种集成LAMMPS分子动力学软件的参数描述方法和规范

摘要

分子动力学是从原子尺度研究材料性质的方法,相对于第一性原理计算方法,分子动力学适合于较大空间尺度和较长时间尺度的材料性质研究。分子动力学中模拟尺度常用的软件是LAMMPS。但LAMMPS软件参数较为复杂,给在第三方平台集成LAMMPS软件带来了难度。具体表现:首先LAMMPS软件中不同材料性质计算(如粘度计算、热导率计算等)参数组合不一致问题;其次LAMMPS软件中不同LAMMPS命令(如fix、pair_style、compute等)参数组合不一致问题;最后LAMMPS软件中同一个LAMMPS命令中参数组合不一致问题。为了使LAMMPS软件的集成开发用户高效的开展集成工作,本文提出LAMMPS参数数据规范和LAMMPS参数解析引擎。首先通过LAMMPS参数数据规范将LAMMPS软件中不同参数组合纳入参数数据规范体系。然后我们通过LAMMPS参数解析引擎来统一解析不同的参数组合,从而以通用且友好的方式集成LAMMPS软件中的不同材料性质计算工具。