苎麻线粒体基因CoxⅡ和atpA与细胞质雄性不育相关性分析

摘要

[目的]探讨线粒体Cox Ⅱ和atpA基因与苎麻CMS的关系.[方法]根据GenBank报道的双子叶植物线粒体Cox Ⅱ和atpA基因编码区高度保守序列设计简并引物,通过PCR技术从苎麻细胞质雄性不育系、保持系和恢复系(简称"三系")mtDNA中扩增目的基因片段;采用DNA Walking策略从3'端和5'端扩增基因片段的未知侧翼序列,分离完整的线粒体CoxⅡ、atpA基因;基于全基因序列和基因表达(RT-PCR法)分析这两个基因在苎麻"三系"间的差异.[结果]分离的苎麻CoxⅡ和atpA基因片段与GenBank中一些双子叶植物同类基因的同源性分别高达95%和97%以上,获得的CoxⅡ、atpA全基因包含了完整的开放阅读框."三系"的CoxⅡ基因在mtDNA水平、转录水平、蛋白质水平上均无明显差异.雄性不育系atpA基因在mtDNA水平、氨基酸序列和蛋白质二级结构上与保持系和恢复系存在比较明显的差异;RT-PCR分析还表明,不育系atpA基因在现蕾期和开花后期的表达量明显低于可育系.[结论]CoxⅡ基因与苎麻CMS可能无关,而不育系atpA基因的序列变异和/或异常表达可能与苎麻CMS关系密切.