马传染性贫血病毒强毒株gag和gp45基因的体内进化分析

摘要

为研究马传染性贫血病毒(EIAV)强毒株体内进化规律,将3匹马分别以1×105TCID50/匹接种EIAVLN40强毒株后,在不同时间点采取外周血,分离单核白细胞.提取白细胞中的DNA,并以其为模板,应用套式PCR技术分别扩增EIAV前病毒DNA的p15,p9和gp45基因,经克隆后进行序列分析.结果显示,与接种前EIAVLN40相比较,p15基因核苷酸和氨基酸平均差异率分别为1.8％(0～2.9％)和1.7％(0～3.6％)；p9分别为2.5％(0.3％～3.8％)和2.9％ (0～4.8％)；gp45-Ⅰ分别为1.3％(0.3％～2.1％)和1.8％(0～3.2％),gp45-Ⅱ分别为2.1％(0～3.4％)和2.6％(0～4.7％).在EIA发热期,每个基因核苷酸和氨基酸差异率最小；在亚临床阶段,每个基因平均差异率总体上相对较高.氨基酸变异位点分析发现,发病期(2-2、3-1)各基因氨基酸序列回复到亲本株EIAVLN40,其余时期p15基因氨基酸稳定变异位点16N/S、88T/S和112M/E;p9基因115E/G和122K/M; gp45-I基因9T/F/L;gp45-Ⅱ基因21E/K和29G/S.此外,p15基因进化树结果显示,发热期(2-2、3-1) p15基因序列与EIAVLN40序列处于同一分支上,亚临床阶段大多数p15基因序列处于另一个大分支上；其他基因进化情况与p15基因类似.对EIAV p15、p9、gp45基因体内进化分析,有助于对EIAV在马体内感染进程的研究,为进一步研究EIAV持续感染和逃避免疫监视的机制提供参考.