基于微卫星分子标记的凡纳滨对虾商业苗种遗传多样性分析

摘要

为研究我国凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)商业苗种的遗传多样性特征,于河北、山东、广东、海南等地采集了6个有代表性的凡纳滨对虾品牌苗种,分别命名为黄骅R、东营M、广州P、广州Z、海南S和海南Z,以8个微卫星标记检测其遗传多样性.结果 显示,6个品牌的凡纳滨对虾在8个位点呈现不同程度的多态性,其平均等位基因数(Na)、期望杂合度(He)、观测杂合度(Ho)和多态信息含量(PIC)分别为4.5～9.5、0.516～0.733、0.346～).550和0.472～0.700,各品牌遗传多样性丰富程度从高到低分别为黄骅R＞广州Z＞广州P＞海南Z＞东营M＞海南S.哈迪-温伯格平衡(HWE)检验显示,4.17％ (2/48)的检测结果表现为显著的偏离(0.01 ＜P＜0.05),58.33％ (28/48)表现为极显著偏离(P＜0.01).分子变异方差分析(AMOVA)发现,12％的变异来自品牌间,24％的变异来自品牌内个体间,其余64％的变异均来自所有品牌个体.UPGMA聚类分析结果显示,6个品牌的凡纳滨对虾聚为2个明显的分支,广州P和广州Z聚为一支,东营M、黄骅R、海南Z和海南S聚为一支.主成分分析(PCA)结果显示,各品牌凡纳滨对虾无法单独进行聚类.本研究初步分析了当前国内养殖凡纳滨对虾的遗传背景,实验结果可为凡纳滨对虾良种选育提供数据支撑.