基于微阵列数据的胃癌相关核心基因的挖掘和鉴定分析

摘要

背景:胃癌(GC)是起源于胃黏膜上皮的恶性肿瘤,在我国恶性肿瘤死亡率中占第3位,早期症状不明显,发现时多已发展至晚期,预后较差。为了筛选GC发生发展的潜在基因,本研究从GEO数据库中获得GSE109476和GSE118916进行生物信息学分析。方法:首先,利用GEO2R识别差异表达基因(DEGs),通过GO和KEGG分析对DEGs进行功能注释。利用STRING工具构建蛋白–蛋白相互作用网络,挖掘出最重要的模块和核心基因。结果:共鉴定出229个DEGs。DEGs的功能变化主要集中在细胞黏附、细胞骨架、细胞外基质和胶原蛋白合成等方面。COL4A1、DCN、FSTL1、SPARC、SERPINH1基因被鉴定为核心基因。结论:综上所述,本研究中发现的DEGs和核心基因有可能成为潜在的诊断和治疗靶点。