mdm2/p53通路相关的乳腺癌差异表达基因分析

摘要

目的 比较乳腺癌和正常乳腺组织的基因表达差异,探讨与mdm2/p53通路相关的差异表达基因.方法 提取11例乳腺癌和将5例正常乳腺组织等比例混合的组织总RNA进行芯片杂交,用SAM软件筛选差异表达基因,用GoMiner软件检索差异表达基因的功能,挑选参与细胞周期和凋亡的基因,通过Pathway分析方法检索与mdm2/p53通路相关的差异基因;用免疫组化方法验证差异基因cyclin A2及其相关基因CDK2在乳腺癌(38例)和正常乳腺组织(16例)中的表达.结果 乳腺癌与正常乳腺组织的差异表达基因共548个,其中参与细胞周期的基因有35个,参与凋亡的基因有23个;与mdm2/p53通路相关的差异基因有4个,分别是eyclin A2,cyclin B1,PCNA,YWHAZ;经免疫组化验证的38例乳腺癌和16例正常乳腺组织的cyclin A2表达阳性率分别为42.1%(16/38,和6.25%(1/16);CDK2表达阳性率分别为47.3%(18/38)和6.25%(1/16),两者均有统计学差异(P＜0.05);在乳腺癌中cyclin A2与CDK2的表达呈正相关,特别值得一提的是如果以≥2+ 为阳性在乳腺癌cyclin A2为26.3%,CDK2为31.5%,而在正常组几乎看不到≥2+的表达.结论 乳腺癌组织与正常乳腺组织相比存在着差异表达基因,与mdm2/p53通路相关的差异基因的异常高表达促进细胞增殖,与乳腺癌的发生密切相关,而cyclin A2和CDK2在乳腺癌共表达并明显高于正常组织其意义还不清楚.