缢蛏(Sinovacula constricta)微卫星标记的分离及近缘物种通用性

摘要

采用磁珠富集和PCR筛选相结合的方法,得到12对缢蛏(Sinonovacula constricta)的多态性微卫星引物.每个位点的观测等位基因数为2-15个,有效等位基因数为1.0339-8.8063个;观测杂合度(Ho)为0.0333-1.0000,平均观测杂合度为0.7525;期望杂合度(He)为0.0333-0.9020,平均期望杂合度为0.6866;多态信息含量(PIC)为0.0320-0.8680.所有位点中,有8个位点属于高度多态位点(PIC＞0.5),SC1-5和SC4-6属于低度多态位点(PIC＜0.25);经Bonferroni校正后,无显著偏离哈迪-温伯格平衡的位点;连锁不平衡检验结果表明,位点间不存在连锁不平衡现象.此外,分析了这些引物在近缘种长竹蛏(Solen strictus)、大竹蛏(Solen grandis)和小刀蛏(Cultellus attenuatus)的通用性情况,结果显示:长竹蛏中,位点SC1-4、SC2-8、SC3-1、SC3-14表现出了高度多态(PIC＞0.5);在大竹蛏中,位点SC3-4、SC3-7、SC4-6表现出了高度多态性(PIC＞0.5),SC2-9为低态位点(PIC＜0.25);在小刀蛏中,位点SC1-7、SC2-9、SC3-4、SC3-14表现出了高度多态性(PIC＞0.5),SC4-6为低态位点(PIC＜0.25).