基于线粒体COⅠ序列的洪泽湖河蚬(Corbicula fluminea)遗传多样性和种群结构分析

摘要

为研究洪泽湖河蚬种群遗传多样性及其遗传结构,采用线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ基因(COⅠ)作为分子标记,采用PCR扩增洪泽湖4个河蚬群体(顾勒河GLH、临淮LH、蒋坝JB和高良涧GLJ)的COI基因片段并进行了序列测定和分析.结果表明,614bp长度的核苷酸片段中,碱基A+T的平均含量为65.0％,明显高于G+C的含量(35.0％).共检测到73个多态位点,多态位点比例为11.9％,77个个体中共获22个单倍型(GenBank登录号:KM659000-KM659021),其中包括3个共享单倍型,4个群体的平均单倍型多样性指数h为0.889,平均核苷酸多样性指数π为0.04499,平均核苷酸差异数K为27.622,其中蒋坝群体的遗传多样性最高,顾勒河群体的遗传多样性最低.22个单倍型间的Kimura 2-paramter遗传距离为0.002-0.100,平均遗传距离为0.0514.NJ法构建的分子系统树显示22个单倍型聚为2个分支.4个群体间的遗传距离达0.03729-0.04969,基于群体间遗传距离构建的NJ系统树中,高良涧群体和顾勒河群体聚为一支,蒋坝群体和临淮群体聚集为一支.AMOVA分析表明,洪泽湖河蚬四群体间总遗传分化系数Fst为0.06325(P＞0.05),93.67％遗传变异存在于群体内部,6.33％变异存在于群体间.中性检验结果和歧点分布图显示,洪泽湖河蚬种群大小保持稳定,未经历明显的种群扩张.