玻璃质壳类底栖有孔虫卷转虫属Ammonia spp.的DNA保存方式和提取效能比较研究

摘要

对有孔虫的DNA进行有效保存及提取是开展有孔虫分子鉴定工作的前提.本研究以探索适合玻璃质壳类底栖有孔虫的DNA保存及提取方法为目的,以中国近海优势属——玻璃质类底栖有孔虫卷转虫属(Ammonia spp.)为模式生物,考察不同温度(20-120℃,间隔10℃)烘干、冷冻(-20℃、-80℃,有水、无水)以及脱氧胆酸钠裂解液(Na deoxycholate,简称DOC)处理(含和不含EDTA)保存有孔虫DNA方法,同时进行了DOC裂解液法和Guanidine裂解液法对Ammonia spp.DNA提取效能的比较.结果显示,烘干保存法中20℃组和30℃组显著优于40℃组(P＜0.05);冷冻保存法中无水组显著优于有水组(P＜0.05);DOC裂解液保存法各组间无显著差异(P＞0.05).三种保存方法综合效果表现为冷冻组显著优于烘干组和裂解液组(P＜0.05);两种DNA提取方法的提取效果都很好,但DOC法更廉价且操作简便.本文给出了一套适用于玻璃质壳类有孔虫的DNA保存和提取的优化方案.