素心蜡梅水孔蛋白基因的克隆与序列分析

摘要

以素心蜡梅为试材,根据已建立的素心蜡梅转录组数据库已知序列设计特异引物,采用PCR技术,克隆并分析了素心蜡梅盛花期花被片水孔蛋白基因序列和氨基酸结构特征,对得到的基因和数据库中的cDNA进行比对,并通过多种生物信息学方法对其编码序列、蛋白结构和进化关系进行了分析预测.结果表明:该试验成功克隆得到长2 264 bp的水孔蛋白基因,命名为CpAQP3.经序列比对,蜡梅CpAQP3基因含5’非编码区50 bp,3’非编码区165 bp,开放阅读框长2 049 bp,编码248个氨基酸.该基因含2个内含子,长度分别为708 bp和594 bp,3个外显子,长度分别为127、250、370 bp.预测该蛋白有多个跨膜螺旋结构,具较强疏水性.该基因属于MIP家族中的TIP亚族,具有家族典型的保守结构域,预测其结构与运输水分具有显著关系.该试验首次从素心蜡梅中克隆得到水孔蛋白基因序列,与已知从磬口腊梅中获得的水孔蛋白序列有明显不同.