一株碳青霉烯耐药高毒力肺炎克雷伯菌耐药及毒力特征分析

摘要

目的 分析1株碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药及毒力特征.方法 将浙江大学医学院附属第二医院粪便中分离到的1株CRKP命名为肺炎克雷伯菌C35,采用微量肉汤稀释法测定抗菌药物的最低抑菌浓度;全基因组测序和基因组分析确定菌株所携带耐药基因和毒力基因;核心基因组单核苷酸多态性(SNP)分型分析CRKP菌株之间的同源性关系;采用接合试验评估耐药基因的转移能力和效率;采用大蜡螟毒力实验测定菌株的毒力表型.结果 肺炎克雷伯菌C35对大多数受试药物耐药,尤其碳青霉烯类、舒巴坦和多黏菌素.SNP分型显示肺炎克雷伯菌C35与多株分离自本院不同病房的CRKP菌株具有很高的同源性.该菌属于ST11型,携带包括blaKPC-2、blaCTX-M-199、mcr-1和tet(A)变异体等在内的13种耐药基因.blaKPc-2基因位于＞69800 bp的IncFⅡ型质粒上,blaCTX-M-199和mcr-1基因共同位于＞64800 bp的IncI2型质粒上,tet(A)变异体位于83628 bp的不可分型质粒上,3种质粒均为可接合性质粒.肺炎克雷伯菌C35还携带rmpA和rmpA2毒力基因以及气杆菌素(aerobactin)相关基因iucABCD,为典型的碳青霉烯耐药高毒力肺炎克雷伯菌(CR-hvKP).该菌在大蜡螟感染模型中也显示了较强的毒力表型,感染肺炎克雷伯菌C35菌株48 h后大蜡螟幼虫存活率仅为16.7％,明显低于无毒力对照菌株的80.0％.结论 本研究在1株肠道定植CR-hvKP中检测到多个可按合性耐药质粒,包括同时携带blaCTX-M-199和mcr-1基因的IncI2质粒,需引起警惕,并对此类菌株进行主动监测.