申克孢子丝菌Pall和Pall样蛋白生物信息学分析

摘要

为初步了解申克孢子丝菌Sporothrix schenckii基因组中真菌特有蛋白Pall和Pall样蛋白的生物学特征,利用在线生物信息学分析软件,对两蛋白理化特征、功能域、二级结构、抗原表位等进行分析预测.发现两蛋白理论分子量分别为24.6kDa和75.6kDa,等电点均偏碱性;属于同一蛋白家族,具有相同的功能域和多个PKC磷酸化位点;两蛋白在近氨基端区域相似度较高,并与其他模式真菌中同源蛋白有很高相似度;同时,两蛋白都有跨膜区,氨基端序列三级结构极为相似,并有丰富的抗原表位.通过生物信息学分析对申克孢子丝菌Pall和Pall样蛋白生物学特征有了初步的认识,为后续实验研究提供有力支持.