胃癌转导信号调控网络在胃癌发生发展中的相关性研究

摘要

目的 筛选胃癌发生发展过程中的差异表达基因,构建差异调控网络.方法 在本文的研究中,我们从公共基因表达数据库(GEO数据库)中下载胃癌相关表达谱数据GSE2685的基因芯片(7个正常组织样本,23个胃癌组织样本),筛选胃癌和正常胃组织的差异基因(P＜ 0.05及差异值＞2或＜-2);计算差异基因与靶基因间的皮尔森相关系数(｜PCC｜＞0.75),构建差异调控网络;GO富集方法分析差异调控网络基因的功能.结果 在这个调控网络中,一些转录因子(TFs)和靶基因在之前的相关研究中已经被证实与胃癌相关.此外我们也发现一些新的转录因子和靶基因与胃癌相关.有效的整合以往的研究结果,让我们对应用转录调控网络识别胃癌相关基因的方法有了新的认识.结论 基于转录调控网络的方法识别胃癌相关基因具有很好的应用价值.