ARDRA分型测定刺参养殖环境中蛭弧菌多样性

摘要

[目的]研究刺参养殖环境中蛭弧菌类微生物的多样性及其组成特征.[方法]对刺参养殖用水进行过滤,获得微生物并提取其总DNA,分别采用两对特异性引物Per和Bac扩增蛭弧菌类微生物相应的16S rRNA基因目的片段.通过核糖体DNA扩增片段限制性内切酶分析(ARDRA)方法,使用Hae Ⅲ和MspⅠ,双酶切各60个目的基因的单克隆,选不同条带克隆进行测序并对测序结果的多重序列分析比对.[结果]确定两对引物分别存在8和9种碱基差异序列,均属于噬菌弧菌属,分属于3个类群中.类群Ⅰ、Ⅱ为优势类群,且均为已知类群,类群Ⅲ为潜在的新类群;Per1 (KP214541)和Bac44 (KP214551)代表菌株分别为优势种.[结论]刺参养殖环境中蛭弧菌具有较高的多样性,包括已知类型和未知类型的蛭弧菌;可进一步进行蛭弧菌的分离、培养,用于刺参养殖中病害防治研究.