基于GSCA数据库分析ctDNA在乳腺癌患者中的应用价值

摘要

目的探讨循环肿瘤DNA(ctDNA)在乳腺癌患者中的应用价值。方法选取2018年1月至2020年1月陆军军医大学大坪医院确诊的31例浸润性乳腺癌患者为研究对象,提取患者术前血液样本、肿瘤组织样本、术后6个月血液样本的ctDNA样本,选取前20个高频突变基因制备基因集。利用GSCA数据库分析基因集蛋白表达水平与乳腺癌患者生存期的关系,比较不同分子分型的基因表达差异,分析基因集表达与免疫细胞浸润和药物敏感性的关系。结果31例患者共检测了87份样本,最常见的突变基因是赖氨酸甲基转移酶2C(KMT2C)(20.69%)、磷脂酰肌醇-3-激酶催化亚单位α(PIK3CA)(18.39%)和肿瘤蛋白53(18.39%);20个基因高低表达结果显示,PIK3CA、核受体结合SET域蛋白1、KMT2C、赖氨酸乙酰转移酶6A(KAT6A)、胰岛素受体底物2(IRS2)与患者无进展生存期相关(P<0.05),KAT6A和IRS2与患者总生存期相关(P<0.05);血小板衍生生长因子受体、间变性淋巴瘤激酶、RecQ样解旋酶4、含F-框WD重复域蛋白7与免疫细胞呈显著正相关;基因集错义突变数目最多,变体类型主要为单核苷酸变异;酪氨酸激酶受体2、IRS2和脂肪非典型钙黏蛋白-1的药物敏感性最显著。结论ctDNA在乳腺癌组织和血液样本中检测结果高度一致,特定变异基因可用于监测复发和解决耐药,ctDNA对评估乳腺癌预后和寻找靶向药物具有一定价值。