筛选三阴型乳腺癌差异表达microRNA的临床转化研究

摘要

目的应用microRNAs（miRNAs）芯片技术筛选成球培养法及贴壁培养法培养细胞系MDA-MB-231差异表达的miRNA,发现三阴型乳腺癌（TNBC）相关的miRNA。方法用干细胞培养基成球培养法筛选TNBC干细胞,应用miRNAs芯片技术筛选成球培养法及贴壁培养法培养细胞系MDA-MB-231差异表达的miRNA,同时选取5例新鲜TNBC癌组织及其癌旁组织运用荧光定量RT-PCR对差异表达的miRNAs进行验证。运用靶基因预测软件预测差异表达miRNAs可能的调控靶基因。结果通过miRNAs芯片的检测及SAM软件分析,选取细胞培养数据中筛选得到TNBC干细胞较TNBC细胞表达上调的5个miRNA（hsa-miR-297、hsa-miR-8063、hsa-miR-6768-5p、hsa-miR-1231、hsa-miR-489-3p）,下调的4个miRNA（hsa-miR-30c-5p、hsa-miR-25-3p、hsa-miR-18a-3p、U25）。荧光定量RT-PCR结果是hsa-miR-297、hsa-miR-8063、hsa-miR-6768-5p、hsa-miR-18a-3p、U25表达上调,hsa-miR-30c-5p、hsa-miR-25-3p、hsamiR-489-3p、hsa-miR-1231表达下调。芯片检测结果及荧光定量RT-PCR结果一致的miRNA为hsa-miR-297、hsa-miR-8063、hsa-miR-6768-5p、hsa-miR-30c-5p、hsa-miR-25-3p,并对其进行生物信息学分析;分析出MicroRNA-297所对应靶基因为SLC7A6、SLC7A5、SLC25A44、7A5、AAK1、SMYD1、NDE1、PDE3B、STC1、SUSD1。结论 MicroRNA-297及其靶基因SLC7A5可能在乳腺癌发生发展及干性形成过程中发挥重要作用。