基于生物信息学分析泛癌中PDPN的表达与预后及与免疫细胞浸润的关系

摘要

目的:探讨平足蛋白(Podoplanin,PDPN)在泛癌中的表达量与预后及PDPN与免疫浸润之闻的关系。为癌症的免疫治疗提供一个断的方向。方法:通过UACLAN、Oncomine和TIMER2.0数据库分析PDPN在泛癌及对应的正常组织中的表达量;通过PrognoScan和Kxplan-Meier Potter数据库分析并验证PDPN与泛癌预后之间的相关性。通过TIMER2.0分析PDPN与不同类型癌症尤其是消化道肿瘤中免疫细胞浸润的相关性。在LinkedOmics以及DAVID、KOBAS数据库中查找与PDPN共表达的基因,并以此检索相关信号通路。STRING数据库寻找并分析PDPN互作的蛋白质。结果:PDPN在大多数癌組织中表达量增加,起到促癌基因的作用,部分癌组织中,PDPN表达量下降,仍可导致恶性肿瘤透展;PDPN表达量的高低与某些恶性肿瘤预后具有显著相关性;PDPN与多种免疫细胞尤其是肿瘤相关成纤维细胞(CAF)之间表现出显著的相关性,提示PDPN与肿瘤免疫浸润相关,可能参与肿瘤微环境的调控。PDPN参与调控多种信号通路。PDPN与CD44及CLEC1B之间存在较强的相互作用。结论:PDPN可以作为泛癌尤其是胃癌、结直肠癌等消化道肿瘤的预后当物标志物。PDPN在多种免疫细胞中表达,通过调节免疫浸润影响恶性肿瘤的进展。