皮肤黑色素瘤放疗耐药基因的筛选及初步鉴定

摘要

目的 筛选出皮肤恶性黑色素瘤放疗敏感性基因,并在生物信息学和细胞水平验证筛选出的候选基因对皮肤恶性黑色素瘤发生、发展的作用.方法 通过全转录组测序及表达谱分析比较野生型人皮肤黑色素瘤细胞SK-MEL-1与辐射耐受型SK-MEL-1的差异基因,以表达量差异最大的基因作为候选基因.TCGA数据库挖掘该候选基因在皮肤恶性黑色素瘤中的表达特征及其对预后的影响.进一步通过构建该基因的敲低、过表达SK-MEL-1细胞株,比较敲低、过表达该基因的细胞对SK-MEL-1细胞增殖、辐射敏感性的影响.结果 通过比较野生型SK-MEL-1与辐射耐受型SK-MEL-1的表达谱,筛选出CDCA8基因为差异表达量最大的基因.该基因在辐射耐受型SK-MEL-1中表达上调.基于TCGA数据库的生物信息学分析提示,该基因在皮肤恶性黑色素瘤中高表达,且表达量与临床分期相关,临床分期高的样本表达量高于低临床分期的样本.此外,高表达组的总生存率和无病生存率均低于低表达组.细胞学水平实验证明,敲低CDCA8基因能明显抑制SK-MEL-1的增殖和提高SK-MEL-1对辐射的敏感性;相反,过表达CDCA8基因能促进SK-MEL-1的增殖和降低SK-MEL-1对辐射的敏感性.结论 CDCA8基因是皮肤恶性黑色素瘤发生、发展的关键基因,且与肤恶性黑色素瘤SK-MEL-1细胞的放疗敏感性相关.抑制CDCA8基因表达是提高皮肤恶性黑色素瘤放疗敏感性的潜在的方法.