黑龙江立克次体感染对小鼠脾脏免疫相关基因转录的影响

摘要

目的分析黑龙江立克次体感染小鼠脾脏免疫相关基因的转录变化,筛选影响黑龙江立克次体感染致病进程的关键靶标。方法取20只雌性C3H/HeN小鼠,随机分为未感染组(0 hpi)、感染3 h组(3 hpi)、感染3 d组(3 dpi)及感染6 d组(6 dpi),每组5只,采用尾静脉注射法感染黑龙江立克次体,在4个时相点解剖小鼠取脾,提取总RNA进行测序,筛选出特异性转录基因并进行GO注释、R语言富集及KEGG可视化功能分析。结果小鼠感染黑龙江立克次体后,脾脏有219930个mRNA发生了特异性转录,通过GO注释及富集筛选出显著性变化的3类基因:(1)35个天然免疫相关基因,其中参与γ干扰素(IFN-γ)信号通路的irg1、gbp10基因转录上调最明显(P<0.05);(2)31个获得性免疫相关基因,其中参与细胞凋亡通路的gzmb基因转录上调最明显(P<0.05);(3)41个炎症反应相关基因,其中参与细胞因子与细胞因子受体信号通路的ccl4基因转录上调最明显(P<0.05)。结论宿主IFN-γ信号通路中的irg1、gbp10基因,细胞凋亡通路中的gzmb基因,细胞因子及细胞因子受体信号通路中的ccl4基因影响黑龙江立克次体感染的致病进程。