DIF14/LMBR1蛋白的分子进化分析

摘要

目的利用生物信息学方法分析DIF14/LMBR1蛋白的分子进化情况并分析其同源蛋白的保守区.方法利用BLAST同源比较分析寻找GenBank中与DIF14/LMBR1高度同源的蛋白序列并下载,应用Clustal X软件对蛋白序列进行多序列对齐,绘制进化树,利用SAM-T99软件分析多个序列之间的保守区.TMpred软件对下载的各种同源的蛋白序列进行跨膜区预测.结果DIF14/LMBR1蛋白在各种真核生物中存在高度保守的同源蛋白,大部分蛋白属于九次跨膜蛋白,各蛋白之间的氨基酸一致性与生物亲缘关系的远近有密切关系,人DIF14/LMBR1与lipocalin-interacting membrane receptor基因可能有相同的祖先基因,但两者功能有所不同.结论DIF14/LMBR1蛋白是真核生物中高度保守的基因,属于九次跨膜蛋白,但在细胞内具体执行的生物学功能有待进一步研究.