人细胞基因组AAVS1位点基因定点整合率的荧光定量PCR检测方法

摘要

基因疗法是将基因导入靶细胞内,以纠正缺陷和异常基因引起的疾病的治疗方法.目前,多个基因治疗药物已经进入临床研究阶段或已上市,为癌症、罕见病、神经性疾病等多个领域的疾病治疗带来了希望.基因治疗中最关键的步骤就是如何将外源基因准确安全地导入宿主细胞.腺相关病毒(adeno-associated virus,AAV)栽体是当前最受欢迎的人类基因治疗栽体之一,它是唯一能定点整合到人类基因组特定位点的病毒栽体.AAV定点整合的位点AAVS1 (the adeno-associated virus site 1)已经被证明是安全的基因整合位点.本实验以Rep蛋白介导基因定点整合至人T淋巴细胞基因组AAVS1住点,随后采用标准曲线定量的方法,对混合细胞克隆AAVS1位点的定点整合率进行定量.实验进行两轮PCR,首先通过常规PCR扩增包含ITR-AAVS1结合位点的序列,然后取标准品和检测样本第一轮PCR产物作为模板,进行第二轮定量PCR.通过本实验中的研究方法可以简单快速地定量分析AAVS1定点整合率.