核内RNA对真核细胞基因组三维高级结构的影响

摘要

目的:研究核内RNA与真核细胞基因组三维结构的关系,并探讨核内RNA对染色体高级结构如拓扑相关结构域(TAD)和A/B区室的影响.方法:利用全基因组染色质构象捕获(Hi-C)技术对正常GM12878细胞和经过RNase处理的GM12878细胞进行染色质相互作用的检测.结果:经RNase处理后,染色质的三维高级结构在整体上变得松散,染色体之间的相互作用增强(秩和检验P<0.05),A/B区室发生改变,并且相比于所有染色体,X染色体在A/B区室上的变化更大.同时,核内RNA的去除也让TAD边界的强度有所减弱(Vilcox校验P<0.05).结论:核内RNA参与了真核细胞基因组三维高级结构的形成,并使TAD和A/B区室更加致密.